이곳은 김 주석이 관저로 사용하던 금수산의사당을 개명한 곳으로, 1995년 7월8일 개관했다. 금수산의사당은 1970년 초 부지공사가 시작됐고 본격적인 건물 신축공사는 1973년 3월 착공됐다. 준공은 1977년 4월 김 주석의 65회 생일을 맞아 이뤄졌다.

금수산기념궁전의 남쪽으로는 대동강이 흐르고 둘레에는 인공으로 판 강, 즉 해자가 있으며 높은 이중 절책으로 둘러싸여 있다. 금수산기념궁전의 서쪽은 김일성종합대학과 맞닿아 있고, 동쪽은 대성산 기슭의평야지대가 펼쳐져 있으며, 북쪽으로 향한 정문은 4차선 도로와 연결돼 있다.

금수산기념궁전 건물 내부에는 2000여명을 일시에 수용할 수 있는 대연회장, 연극 공연무대 등의 시설을 갖추고 있다. 1990년 10월 중순 평양에서 열렸던 제2차 남북고위급회담 때는 당시 강영훈 국무총리를 비롯한 남측 대표단이 이곳을 방문해 김 주석과 면담한 적도 있다.